苹果日报于北京时间五月二十九日引述知情人士认为，北京国安部伪造文件来诬告王丹和王军涛，可能与中共高层权力斗争有关：有人欲借「六四」问题打击以胡锦涛为首的「团派」。
北京国安部指王丹及王军涛做台湾间谍的假文件中，曾提及现居北京的异见人士张祖桦，他当年是中共中央一个直属机关的团委书记兼团中央委员，积极参加「六四」，因他与当年的团中央书记、现任统战部长刘延东关系好，得到刘的保护，「六四」后不用坐牢。目前张祖桦也没被指控为台湾间谍，上星期还联同刘晓波等六十七名知识分子联署，要求平反「六四」。
事实上，八九年波澜壮阔的民运，吸引了无数忧国忧民的年轻人投身当中，而各级共青团系统就是其中一个涉足最深的部门。中国人权民运中心负责人卢四清指出，当时他在湖南省中南工业大学担任官方的学生会主席，常参加湖南团省委的会议，也曾目睹或听闻绝大部份中央及各级团委的干部，对八九民运持非常支持和同情的态度。当年曾积极投身民运的共青团干部，现时多已身居各省及中央的要职。
至于被指收钱做台谍的王军涛，因为是七六年「四五」天安门事件（反对「四人帮」及要求邓小平复出）的英雄，七十年代末获选为共青团第十届中央委员会候补委员。
当年与他一同跻身团中央的还有前政治局常委胡启立、福建省委书记宋德福、民政部长李学举、国家民族事务委员会主任等。王军涛是一个早已褪色的「团派」，北京国安部在证据不足的情况下，还指控王军涛是台湾间谍，不是在抹黑吗？
虽然这种对「团派」的抹黑成效有限，但政治对手事实上也很难找到其他机会，只能见缝插针，不放过任何打击「团派」的机会。