據中央電視臺報道，中國南海海域漁業捕撈能力大大超過了資源的再生力。海洋的底部原本是凹凸不平的，但是由於捕撈船的拖網在海底長期拖拉，許多礁石都遭到破壞。沒有了礁體，海洋微生物無法生存，海底生態環境因此出現荒漠化的趨勢。另外，大量沒有經過處理的廢水直接排入大海，造成海水水質不斷惡化，赤潮頻繁發生。
珠江口海域本來有200多種海洋魚類繁衍生長，現在魚類品種已經減少到50餘種，國家一級重點保護動物中華白海豚在珠江口只剩下400頭左右。環境的惡化也使得漁業資源出現衰退現象，漁業資源的平均密度只有80年代的八分之一，著名的萬山、甲子等六大漁汛已基本消失，一些海域甚至出現無魚可捕的情況。