然而，令人不解的是，就在钱其琛结束访问返抵北京之时，新华社却发表长篇评论文章，指台湾的副总统吕秀莲支持法轮功，又指台独势力与法轮功合流，利用法轮功进行分裂活动。
吕秀莲除了公开出席过法轮功在台北的聚会外，是否还有其他与法轮功「相互勾结」的证据，我们不得而知，或许北京另有渠道获悉。但在海外的一般理解是，吕秀莲出席法轮功台北聚会的主要动机是想表明，不管人们是否赞成法轮功，但却都应该捍卫法轮功的言论自由。许多香港人看法轮功问题，实际上也是持这一态度。
观察家认为，如今新华社的评论将法轮功问题和台独问题混为一谈，不知江老先生又犯了什么病？从来没听说法轮功要分裂中国，也没听说法轮功支持台湾独立呀！不过江先生调集百万大警镇压法轮功没成功倒是人所共知的。既然眼皮底下的镇压都失败了，隔一个海峡谈镇压，那就看能不能把海底动物给吓着。